Продолжение первого сезона FMP. Сюжет развивается дальше. Сагара продолжает ездить в командировки, причем во время перелета к месту и обратно умудряется еще и делать домашние задания, для подержания обычной для него миссии охраны Чидори. Все начинается с того, что для спасения беженцев, секретная организация Мифрил отправляет отряд, включающий Сосуке, в республику Балик, где идёт гражданская война. Бойцы вооруженны лучшим оружием, однако им противостоит правительственная армия, чьё вооружение ничуть не уступает вражеским.
Основной набор героев остался тот же, набор злодеев пополнился.
Подросли главные герои сериала. Сосуке начал задумываться над смыслом собственной жизни, его поступки стали, наконец, логичны.
Поклонники Full Metal Panic? Fumoffu, возможно, будут разочарованы - юмора стало заметно меньше. Но зато лучше раскрыты характеры Сагары, Чидори и Тессы.